Tytułowego agenta 47 zaprojektowano genetycznie, aby stanowił wybitnie pożytecznym zabójcą w treści. Jest typowy ale z modnych dwóch cyfr kodu, który wytatuowano mu na karku. Obdarzony wielką siłą, siłą i wyobraźnią jest intensywną maszynką do sprzątania. Musi stawić czoło wielkiej korporacji, która decyduje zauważyć jego przeszłość oraz ułożyć armię super zabójców. Dodaje energii z małą kobietą, jaka potrafi mu ułatwić także wraz wypowiadają wojnę śmiertelnemu wrogowi.