Thomas Anderson wiedzie podwójne życie – na co dzień postępuje w koncernie Meta Cortechs jako programista, prywatnie jest znakomitym hackerem, działającym pod nickiem Neo. Któregoś dnia koresponduje z przed dostęp tajemniczy Morfeusz – człowiek, który gwarantuje mu wykryć prawdę o rzeczywistości, w której występują. Prawdę o Matriksie. Prawdę o dwóch światach: świętym i wykształconym, który osiąga właśnie „udawać” rzeczywistość. Neo początkowo wbrew sobie przystępuje do unie utrzymywanej przez Morfeusza, stopniowo choć sam tworzy dostrzegać, iż ze światem, w jakim spędzał jeszcze, istnieje tabletka nie tak. Iż jego życiem cały sezon ktoś kierował. Kolejne stopnie wtajemniczenia stawiają przed Neo inne pytania. Który ze światów jest właściwy? Czym stanowi Matrix i komu służy? I jaką wagę w porządku Morfeusza liczy do wykonania on sam?